Genomické PH pro sonografické měření MLLT
16.08.2023, K. Malát, A. Birovaš |
Další genomické plemenné hodnoty jsou na světě. Možná trochu překvapivě jde o plemenné hodnoty získané z dat z měření nejdelšího zádového svalu (MLLT), které od roku 2019 probíhá u plemene aberdeen angus. Plemenné hodnoty jsou spočítány pro několik údajů s tím, že hlavní jsou tři: výška tuku nad roštěncem, plocha roštěnce a podíl intramuskulárního tuku. U všech relativních plemenných hodnot (PRH) platí, že průměr je standardizován na hodnotu 100 a směrodatná odchylka je 10. Jinými slovy, jedinci s RPH nad 105 jsou zlepšovateli dané hodnoty a naopak.
Novinkou v tomto hodnocení jsou pak absolutní PH v jednotkách dané vlastnosti. Chovatel si tak může lépe uvědomit o kolik je zvíře lepší / horší než jiné. Zveřejněny jsou GEPH pouze od zvířat chovatelů, kteří se za dobu sběru dat do měření zapojili a u každého jedince je rozlišeno, zda bylo zvíře změřeno či nikoliv a zda je ogenotypované nebo ne.
Jak s výsledky pracovat
Co přesně jednotlivé výsledky znamenají a jak je interpretovat, si můžeme demonstrovat na konkrétním příkladu býka APA 335 Edward ze Záhoří. Jde o plemeníka, který byl sám sonograficky skenován (užitkovost = 1) a do výpočtu byly zahrnuty i údaje získané genotypováním (genotyp = 1) Tento býk neměl žádné potomky, které bychom také skenovali (N_pot = 0). Relativní PH (RPH) pro hmotnost při skenování – tedy v cca roce věku – je 90 s vysokou spolehlivostí 0,62. V tomto případě se jedná o vlastnost, kterou má býk pro průměrem populace. Mnohem lepší jsou ukazatele kvality masa – pro oba tuky má hodnotu kolem 110 s vysokou spolehlivostí nad 60%. RPH pro plochu roštěnce je průměrná a jeho genetický přínos 0,83 cm2 (vyjádřené absolutní PH pro plochu roštěnce). Jasným zlepšovatelem je pak v podílu intramuskulárního tuku, kdy jej RPH 112 řadí do 16% nejlepších jedinců a dle absolutní PH je jeho genetická odchylka 0,035 mm se uspokojivou spolehlivostí 0,42.
Co výsledky ukázaly a k čemu slouží
Vypočtené plemenné hodnoty ukázaly, že mezi jedinci je dostatečná variabilita a vzhledem k tomu, že pro plemeno aberdeen angus je podíl intramuskulárního tuku a plochy roštěnce jedním z velice důležitých kvalitativních parametrů masné užitkovosti, je žádoucí při šlechtění věnovat pozornost i těmto znakům. Hlavní výhodou předpovědi genomických plemenných hodnot (GEPH) ve srovnání s konvenčními plemennými hodnotami je zejména to, že GEPH lze předpovědět i pro mladá genotypovaná zvířata bez užitkovosti (nejen pro jedince s užitkovostí a jejich předky) a také to, že dojde k významnému zvýšení spolehlivosti předpovězených PH pro genotypované jedince. V žádném případě to však neznamená, že se obejdeme bez fenotypových informací a bez kontroly užitkovosti. I pro předpověď GEPH jsou nezbytné další ročníky sběru výsledků ultrazvukového měření MLLT. Jen za tohoto předpokladu bude možné úspěšně předpovědět genomické plemenné hodnoty i pro další generace mladých jedinců.
Jak dál?
Zveřejněný soubor ve formátu MS Excel je prvním krokem souvisejícím s publikováním výsledků. Následovat budou debaty nad implementací dat do svazové databáze, aby byly výsledky dostupné také v online plemenné knize a ve webKUMP. Kromě toho budeme muset s angusskými chovateli řešit i budoucnost sonografického skenování, a to včetně finančních aspektů, neboť projekt, ze kterého byly tyto činnosti doposud hrazeny, letos končí a bude třeba hledat zdroje k finančnímu pokrytí budoucích měření.
První informace k genomickým plemenných hodnotám pro MLLT přinesl tento článek, detailům ohledně GEPH je věnován rovněž samostatný příspěvek, který bude otištěn v červnovém čísle svazového Zpravodaje.
Výsledek vznikl za podpory Ministerstva zemědělství – projekt NAZV QK1910059 a institucionální podpora MZE-RO0723.
*******************************************************************************
Související články:
• Genomické plemenné hodnoty pro MLLT
• Sonografické skenování zvířat angus
• Měření MLLT u plemene aberdeen angus již podruhé
• Další sonografické měření AA se blíží
• Sonografické měření u plemene aberdeen angus
• Výsledky měření MLLT u plemene aberdeen angus
• Měření MLLT u plemene aberdeen angus
• Sonografické měření u plemene aberdeen angus
Novinkou v tomto hodnocení jsou pak absolutní PH v jednotkách dané vlastnosti. Chovatel si tak může lépe uvědomit o kolik je zvíře lepší / horší než jiné. Zveřejněny jsou GEPH pouze od zvířat chovatelů, kteří se za dobu sběru dat do měření zapojili a u každého jedince je rozlišeno, zda bylo zvíře změřeno či nikoliv a zda je ogenotypované nebo ne.
Jak s výsledky pracovat
Co přesně jednotlivé výsledky znamenají a jak je interpretovat, si můžeme demonstrovat na konkrétním příkladu býka APA 335 Edward ze Záhoří. Jde o plemeníka, který byl sám sonograficky skenován (užitkovost = 1) a do výpočtu byly zahrnuty i údaje získané genotypováním (genotyp = 1) Tento býk neměl žádné potomky, které bychom také skenovali (N_pot = 0). Relativní PH (RPH) pro hmotnost při skenování – tedy v cca roce věku – je 90 s vysokou spolehlivostí 0,62. V tomto případě se jedná o vlastnost, kterou má býk pro průměrem populace. Mnohem lepší jsou ukazatele kvality masa – pro oba tuky má hodnotu kolem 110 s vysokou spolehlivostí nad 60%. RPH pro plochu roštěnce je průměrná a jeho genetický přínos 0,83 cm2 (vyjádřené absolutní PH pro plochu roštěnce). Jasným zlepšovatelem je pak v podílu intramuskulárního tuku, kdy jej RPH 112 řadí do 16% nejlepších jedinců a dle absolutní PH je jeho genetická odchylka 0,035 mm se uspokojivou spolehlivostí 0,42.
• Genomické plemenné hodnoty pro MLLT (soubor MS Excel) • |
Co výsledky ukázaly a k čemu slouží
Vypočtené plemenné hodnoty ukázaly, že mezi jedinci je dostatečná variabilita a vzhledem k tomu, že pro plemeno aberdeen angus je podíl intramuskulárního tuku a plochy roštěnce jedním z velice důležitých kvalitativních parametrů masné užitkovosti, je žádoucí při šlechtění věnovat pozornost i těmto znakům. Hlavní výhodou předpovědi genomických plemenných hodnot (GEPH) ve srovnání s konvenčními plemennými hodnotami je zejména to, že GEPH lze předpovědět i pro mladá genotypovaná zvířata bez užitkovosti (nejen pro jedince s užitkovostí a jejich předky) a také to, že dojde k významnému zvýšení spolehlivosti předpovězených PH pro genotypované jedince. V žádném případě to však neznamená, že se obejdeme bez fenotypových informací a bez kontroly užitkovosti. I pro předpověď GEPH jsou nezbytné další ročníky sběru výsledků ultrazvukového měření MLLT. Jen za tohoto předpokladu bude možné úspěšně předpovědět genomické plemenné hodnoty i pro další generace mladých jedinců.
Jak dál?
Zveřejněný soubor ve formátu MS Excel je prvním krokem souvisejícím s publikováním výsledků. Následovat budou debaty nad implementací dat do svazové databáze, aby byly výsledky dostupné také v online plemenné knize a ve webKUMP. Kromě toho budeme muset s angusskými chovateli řešit i budoucnost sonografického skenování, a to včetně finančních aspektů, neboť projekt, ze kterého byly tyto činnosti doposud hrazeny, letos končí a bude třeba hledat zdroje k finančnímu pokrytí budoucích měření.
První informace k genomickým plemenných hodnotám pro MLLT přinesl tento článek, detailům ohledně GEPH je věnován rovněž samostatný příspěvek, který bude otištěn v červnovém čísle svazového Zpravodaje.
Výsledek vznikl za podpory Ministerstva zemědělství – projekt NAZV QK1910059 a institucionální podpora MZE-RO0723.
*******************************************************************************
Související články:
• Genomické plemenné hodnoty pro MLLT
• Sonografické skenování zvířat angus
• Měření MLLT u plemene aberdeen angus již podruhé
• Další sonografické měření AA se blíží
• Sonografické měření u plemene aberdeen angus
• Výsledky měření MLLT u plemene aberdeen angus
• Měření MLLT u plemene aberdeen angus
• Sonografické měření u plemene aberdeen angus